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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
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* gnu: bless: Remove bundled sources for sparsehash.Ricardo Wurmus2016-03-17
* gnu: Add CD-HIT.Ricardo Wurmus2016-03-17
* gnu: Add r-dnacopy.Roel Janssen2016-03-16
* gnu: Add codingquarry.Rob Syme2016-03-16
* gnu: htsjdk: Use ant-build-system.Ricardo Wurmus2016-03-14
* gnu: Add pyicoteo.Ricardo Wurmus2016-03-14
* gnu: Add bioawk.Roel Janssen2016-03-10
* gnu: python-pysam: Move cython and setuptools to native inputs.Ricardo Wurmus2016-03-03
* gnu: deeptools: Update to 2.1.1.Ricardo Wurmus2016-03-03
* gnu: deeptools: Change "propagated-inputs" to "inputs".Ricardo Wurmus2016-03-03
* gnu: Add python-pybigwig.Ricardo Wurmus2016-03-03
* gnu: python-pysam: Update to 0.8.4.Ricardo Wurmus2016-03-03
* gnu: python-pysam, python2-pysam: Move to bioinformatics.scm.Ricardo Wurmus2016-03-03
* gnu: r-go-db: Bioconductor changed URL for data downloads.Pjotr Prins2016-03-01
* gnu: r-iranges: Update to 2.4.8.Pjotr Prins2016-03-01
* gnu: r-s4vectors: Update to 0.8.11.Pjotr Prins2016-03-01
* gnu: Add PePr.Ricardo Wurmus2016-03-01
* gnu: Add bwa-pssm.Ricardo Wurmus2016-03-01
* gnu: Fix misplaced commas (unquote).Mark H Weaver2016-02-27
* gnu: Add missing import in bioinformatics.scm.Ludovic Courtès2016-02-25
* gnu: Add libBigWig.Ricardo Wurmus2016-02-25
* gnu: r-topgo: Add missing input.Ricardo Wurmus2016-02-24
* gnu: Add r-graph.Ricardo Wurmus2016-02-24
* gnu: Add r-org-mm-eg-db.Ricardo Wurmus2016-02-24
* gnu: Add r-org-dm-eg-db.Ricardo Wurmus2016-02-24
* gnu: Add r-org-ce-eg-db.Ricardo Wurmus2016-02-24
* gnu: Add r-org-hs-eg-db.Ricardo Wurmus2016-02-24
* gnu: htseq: Add PySam to inputs.Ricardo Wurmus2016-02-16
* gnu: Add StringTie.Ricardo Wurmus2016-02-16
* gnu: prodigal: Update to 2.6.3.Ben Woodcroft2016-02-16
* gnu: r-annotationdbi: Update to 1.32.3.Ricardo Wurmus2016-02-15
* gnu: vsearch: Update to 1.10.0.Ben Woodcroft2016-02-15
* gnu: macs: Update to 2.1.0.20151222.Ricardo Wurmus2016-02-12
* gnu: macs: Use "pypi-uri".Ricardo Wurmus2016-02-12
* gnu: Update sortmerna to 2.1.Ben J. Woodcroft2016-02-02
* gnu: sra-tools: Update to 2.5.7.Ben Woodcroft2016-01-26
* gnu: ncbi-vdb: Update to 2.5.7.Ben Woodcroft2016-01-26
* gnu: ngs-sdk: Update to 1.2.3.Ben Woodcroft2016-01-26
* gnu: Add sortmerna.Ben Woodcroft2016-01-25
* gnu: Add cufflinks.Ricardo Wurmus2016-01-23
* gnu: Add TopHat.Ricardo Wurmus2016-01-23
* gnu: star: Update to 2.5.1b.Ricardo Wurmus2016-01-23
* gnu: star: Use "modify-phases" syntax.Ricardo Wurmus2016-01-23
* gnu: r-qtl: Update to 1.38-4.Pjotr Prins2016-01-21
* gnu: samtools-0.1: Adapt to changes in "samtools" variable.Ricardo Wurmus2016-01-16
* gnu: r-go-db: Add missing input.Ricardo Wurmus2016-01-14
* gnu: bowtie: Update to 2.2.6.Ricardo Wurmus2016-01-14
* gnu: orfm: Update to 0.5.3.Ben Woodcroft2016-01-14
* gnu: samtools: Update to 1.3.Ricardo Wurmus2016-01-13
* gnu: Add fxtract.Ben Woodcroft2016-01-12
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