guix-patches - Patches for guix

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* \|	gnu: Add samtools-1.2.	Ricardo Wurmus	2021-12-09
* \|	gnu: Add htslib-for-samtools-1.2.	Ricardo Wurmus	2021-12-09
* \|	gnu: tadbit: Update to 1.0.1-1.5c4c1dd.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: paml: Pass -fcommon to compiler.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: paml: Remove trailing #T.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: sambamba: Remove trailing #T.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: discrover: Add texlive-fonts-ec to inputs.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: discrover: Remove trailing #T.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: tbsp: Update to 1.0.0-2.dc30c03.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: mantis: Update to 0.1-2.b6979a2.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: imp: Disable tests.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: snap-aligner: Update to 2.0.0.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: snap-aligner: Remove trailing #T.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: snap-aligner: Run tests conditionally.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: khmer: Cythonize source files.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: cwltool: Update to 3.1.20211107152837.	Ricardo Wurmus	2021-12-08
* \|	gnu: newick-utils: Pass -fcommon to compiler.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: blasr: Update to 5.3.5.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: blasr: Remove trailing #T.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: blasr-libcpp: Update to 5.3.5.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: htseq: Update to 0.12.3.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: clipper: Update to 2.0.1.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: pbbam: Update to 1.7.0.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: bwa-pssm: Fix build.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: Add pbcopper.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: fsom: Build with GCC 6.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: python-velocyto: Remove generated C files.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: python-schema-salad: Update to 8.2.20211116214159.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: taxtastic: Update to 0.9.2.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: taxtastic: Run tests conditionally.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: python-dendropy: Update to 4.5.1.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: python-cooler: Use python-cytoolz-for-cooler.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: phylip: Update to 3.697.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: phylip: Pass -fcommon to compiler.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: phylip: Remove trailing #T.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: subread: Remove trailing #T.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: subread: Update to 2.0.3.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: subread: Update home page..	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: subread: Pass -fcommon to compiler.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: hisat: Update to 0.1.6.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: hisat: Remove trailing #T.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: hisat: Remove invalid characters.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: crossmap: Update to 0.6.1.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: Remove python2-bx-python.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: python-bx-python: Update to 0.8.12.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: Remove pbtranscript-tofu.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: python-pyfit-sne: Update to 1.2.1.	Ricardo Wurmus	2021-12-07
* \|	gnu: f-seq: Update name of commons-cli JAR.	Ricardo Wurmus	2021-12-06
* \|	gnu: f-seq: Remove trailing #T.	Ricardo Wurmus	2021-12-06
* \|	gnu: f-seq: Simplify snippet.	Ricardo Wurmus	2021-12-06