summaryrefslogtreecommitdiff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
Commit message (Expand)AuthorAge
* gnu: mantis: Limit to x86_64-linux.Efraim Flashner2019-01-07
* gnu: Add mantis.Ricardo Wurmus2019-01-07
* gnu: discrover: Comment on attempt of minimal texlive-union.Pierre Neidhardt2018-12-20
* gnu: gess: Don't hardcode python version.Efraim Flashner2018-12-17
* gnu: mash: Use C++ 14.Christopher Baines2018-12-05
* gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.5.Ricardo Wurmus2018-12-04
* gnu: bless: Adjust to zlib static output.Marius Bakke2018-11-24
* gnu: mosaik: Fix FTBFS from b90289dadc8ee15848ce911a2bdcd3ae8302d58c.Marius Bakke2018-11-24
* gnu: pigx-scrnaseq: Use latest snakemake.Ricardo Wurmus2018-11-23
* gnu: pigx-bsseq: Use latest snakemake.Ricardo Wurmus2018-11-23
* gnu: pigx-chipseq: Use latest snakemake.Ricardo Wurmus2018-11-23
* gnu: python-loompy: Remove python-typing.Ricardo Wurmus2018-11-23
* Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2018-11-20
|\
| * gnu: r-ensembldb: Update to 2.6.2.Roel Janssen2018-11-19
| * gnu: r-msnbase: Update to 2.8.1.Roel Janssen2018-11-19
| * gnu: r-genomeinfodb: Update to 1.18.1.Roel Janssen2018-11-19
| * gnu: Add nanopolish.pimi2018-11-15
| * gnu: sambamba: Update to 0.6.8.Roel Janssen2018-11-15
* | gnu: bioinformatics: Return #t from all phases and snippets.Mark H Weaver2018-11-14
|/
* gnu: Add jamm.Ricardo Wurmus2018-11-14
* gnu: r-txdb-mmusculus-ucsc-mm10-knowngene: Update to 3.4.4.Ricardo Wurmus2018-11-13
* gnu: r-org-mm-eg-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus2018-11-13
* gnu: r-org-dm-eg-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus2018-11-13
* gnu: r-org-ce-eg-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus2018-11-13
* gnu: r-org-hs-eg-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus2018-11-13
* gnu: r-genomationdata: Update to 1.14.0.Ricardo Wurmus2018-11-13
* gnu: r-go-db: Update to 3.7.0.Ricardo Wurmus2018-11-13
* gnu: r-genomeinfodbdata: Update to 1.2.0.Ricardo Wurmus2018-11-13
* gnu: r-s4vectors: Update to 0.20.1.Ricardo Wurmus2018-11-11
* gnu: r-ensembldb: Update to 2.6.1.Ricardo Wurmus2018-11-09
* gnu: r-biostrings: Update to 2.50.1.Ricardo Wurmus2018-11-09
* gnu: r-biocviews: Update to 1.50.5.Ricardo Wurmus2018-11-09
* gnu: pplacer-scripts: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: roary: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: seek: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: sailfish: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: vsearch: Update to 2.9.1.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: sra-tools: Update to 2.9.3.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: plink-ng: Fetch sources from git.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: ncbi-vdb: Update to 2.9.3.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: ngs-sdk: Update to 2.9.3.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: ngs-sdk: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: emboss: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: taxtastic: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: sra-tools: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: muscle: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: newick-utils: Remove custom autoconf phase.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: mash: Remove custom autoconf phase.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: vsearch: Remove custom autogen phase.Ricardo Wurmus2018-11-08
* gnu: java-picard-1.113: Use INVOKE.Ricardo Wurmus2018-11-08