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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
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* gnu: cd-hit: Support longer sequences.Ricardo Wurmus2019-03-07
* gnu: r-org-mm-eg-db: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-org-hs-eg-db: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-org-dm-eg-db: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-org-ce-eg-db: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-txdb-mmusculus-ucsc-mm10-knowngene: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-bsgenome-dmelanogaster-ucsc-dm3: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-bsgenome-celegans-ucsc-ce10: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-bsgenome-celegans-ucsc-ce6: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-bsgenome-mmusculus-ucsc-mm10: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-bsgenome-mmusculus-ucsc-mm9: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-bsgenome-hsapiens-ucsc-hg19: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-bsgenome-hsapiens-1000genomes-hs37d5: Move to (gnu packages bioconduct...Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-txdb-hsapiens-ucsc-hg19-knowngene: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-geneplotter: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-copynumber: Move to (gnu packages bioconductor).Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: bismark: Update to 0.20.1.Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: Add r-scde.Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: Add bowtie1.Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: Add genrich.Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: r-dnacopy: Remove duplicate definition.Ricardo Wurmus2019-03-06
* gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.31.Ricardo Wurmus2019-03-02
* gnu: Add velvet.Ricardo Wurmus2019-03-01
* gnu: discrover: Remove indirect TexLive dependencies.Ricardo Wurmus2019-03-01
* gnu: flexbar: Fix reproducibility bug.Ricardo Wurmus2019-02-27
* gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.21.Ricardo Wurmus2019-02-25
* gnu: discrover: Replace "texlive" with a texlive-union.Ricardo Wurmus2019-02-25
* gnu: pplacer: Remove the package, which is affected by a CVE on ocaml@4.01.Andreas Enge2019-02-19
* gnu: Remove unneeded uses of python{,2}-minimal.Marius Bakke2019-02-17
* gnu: Add python-pyfit-sne.Ricardo Wurmus2019-02-15
* gnu: python-pybedtools: Update to 0.8.0 and fix build.Maxim Cournoyer2019-02-12
* gnu: Add cnvkit.Ricardo Wurmus2019-02-12
* gnu: rcas-web: Update to 0.1.0.Ricardo Wurmus2019-02-08
* gnu: star: Update to 2.7.0b.Ricardo Wurmus2019-02-06
* gnu: star: Update to 2.7.0a.Ricardo Wurmus2019-01-30
* gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.34.2.Ricardo Wurmus2019-01-28
* gnu: r-variantannotation: Update to 1.28.10.Ricardo Wurmus2019-01-28
* gnu: r-qtl: Update to 1.44-9.Ricardo Wurmus2019-01-28
* gnu: r-optparse: Update to 1.6.1.Ricardo Wurmus2019-01-28
* gnu: Move most packages from guile.scm to new module.Ricardo Wurmus2019-01-28
* gnu: pepr: Use PYPI-URI.Ricardo Wurmus2019-01-25
* gnu: python2-warpedlmm: Use PYPI-URI.Ricardo Wurmus2019-01-25
* gnu: Move Python compression packages to new module.Ricardo Wurmus2019-01-15
* gnu: Separate Python core packages from the rest.Ricardo Wurmus2019-01-15
* gnu: r-biocgenerics: Move to bioconductor.Ricardo Wurmus2019-01-13
* gnu: r-annotate: Move to bioconductor.Ricardo Wurmus2019-01-13
* gnu: r-vegan: Move from bioinformatics to cran.Ricardo Wurmus2019-01-13
* gnu: r-rtracklayer: Update to 1.42.1.Ricardo Wurmus2019-01-12
* gnu: r-scater: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus2019-01-12
* gnu: r-singlecellexperiment: Update to 1.4.1.Ricardo Wurmus2019-01-12
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