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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
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* Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver2019-09-06
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| * gnu: Add samblaster.Ricardo Wurmus2019-09-06
| * gnu: libbigwig: Update to 0.4.4.Ricardo Wurmus2019-09-05
| * gnu: python-pyfaidx: Remove python-setuptools as an input.Christopher Baines2019-09-05
| * gnu: umi-tools: Remove python-setuptools as an input.Christopher Baines2019-09-05
| * gnu: bwa-meth: Capture one more reference to "bwa".Ricardo Wurmus2019-09-05
| * gnu: r-ldblock: Update to 1.14.2.Ricardo Wurmus2019-09-02
| * gnu: r-seurat: Update to 3.1.0.Ricardo Wurmus2019-09-02
| * gnu: r-rtracklayer: Update to 1.44.3.Ricardo Wurmus2019-09-02
| * gnu: r-biomart: Update to 2.40.4.Ricardo Wurmus2019-09-02
| * gnu: r-annotationdbi: Update to 1.46.1.Ricardo Wurmus2019-09-02
| * gnu: r-iranges: Update to 2.18.2.Ricardo Wurmus2019-09-02
| * gnu: Move non-compilers out of haskell.scm.Robert Vollmert2019-08-31
* | Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver2019-08-22
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| * gnu: edirect: Update to 12.1.20190819.Efraim Flashner2019-08-20
| * gnu: r-gviz: Update to 1.28.1.Ricardo Wurmus2019-08-19
| * gnu: r-edger: Update to 3.26.7.Ricardo Wurmus2019-08-16
* | Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2019-08-13
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| * gnu: freebayes: Simplify and enable tests.Ricardo Wurmus2019-08-09
| * gnu: freebayes: Move bamtools to inputs.Ricardo Wurmus2019-08-09
| * gnu: Add freebayes.Pierre Neidhardt2019-08-09
| * gnu: Add vcflib.Pierre Neidhardt2019-08-09
| * gnu: r-hdf5array: Update to 1.12.2.Ricardo Wurmus2019-08-08
| * gnu: r-biocparallel: Update to 1.18.1.Ricardo Wurmus2019-08-08
| * Revert "gnu: Add vcflib."Efraim Flashner2019-08-08
| * Revert "gnu: Add freebayes."Efraim Flashner2019-08-08
| * gnu: Add freebayes.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Add vcflib.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Add fastahack.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Add fsom.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Add multichoose.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Add smithwaterman.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Add tabixpp.Pierre Neidhardt2019-08-08
| * gnu: Remove ghc-parsec, ghc-stm, ghc-text, ghc-xhtml.Robert Vollmert2019-08-07
| * gnu: r-msnid: Update to 1.18.1.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-rcas: Update to 1.10.1.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.36.4.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-rtracklayer: Update to 1.44.2.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-summarizedexperiment: Update to 1.14.1.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-biomart: Update to 2.40.3.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-limma: Update to 3.40.6.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: r-edger: Update to 3.26.6.Ricardo Wurmus2019-08-06
| * gnu: khmer: Make gzip timestamps writable.Brian Leung2019-08-05
* | gnu: prank: Update to 170427.Marius Bakke2019-07-31
* | Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2019-07-31
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| * gnu: Explicitly refer to 'guile-json-1' when needed.Ludovic Courtès2019-07-25
* | Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2019-07-22
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| * gnu: htslib: Propagate zlib.Ricardo Wurmus2019-07-22
* | gnu: bpp: Use the default GCC.Marius Bakke2019-07-18
* | Merge branch 'master' into core-updatesLudovic Courtès2019-07-17
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