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* Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2018-05-06
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| * gnu: Use HTTPS for www.boost.org.Tobias Geerinckx-Rice2018-05-01
* | Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver2018-04-30
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| * gnu: roary: Update to 3.12.0.Roel Janssen2018-04-28
| * gnu: star: Update to 2.6.0a.Roel Janssen2018-04-28
| * gnu: multiqc: Update to 1.5.Roel Janssen2018-04-28
| * gnu: express: Link with shared protobuf library.Roel Janssen2018-04-28
| * gnu: bamtools: Update to 2.5.1.Roel Janssen2018-04-28
| * gnu: taxtastic: Update to 0.8.5.Roel Janssen2018-04-28
| * gnu: vsearch: Update to 2.8.0.Ben Woodcroft2018-04-27
| * gnu: diamond: Update to 0.9.21.Ben Woodcroft2018-04-27
| * gnu: bedops: Update to 2.4.33.Roel Janssen2018-04-27
| * gnu: samtools: Update to 1.8.Roel Janssen2018-04-27
| * gnu: bcftools: Update to 1.8.Roel Janssen2018-04-27
| * gnu: htslib: Update to 1.8.Roel Janssen2018-04-27
| * gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.15.Ricardo Wurmus2018-04-22
| * gnu: r-seurat: Update to 2.3.0.Ricardo Wurmus2018-04-21
| * gnu: r-scran: Update to 1.6.9.Ricardo Wurmus2018-04-21
| * gnu: r-hitc: Update to 1.22.1.Ricardo Wurmus2018-04-21
| * gnu: r-ldblock: Update to 1.8.1.Ricardo Wurmus2018-04-21
| * gnu: r-erma: Update to 0.10.1.Ricardo Wurmus2018-04-21
| * gnu: r-gprofiler: Update to 0.6.6.Ricardo Wurmus2018-04-21
| * gnu: r-ggbio: Update to 1.26.1.Ricardo Wurmus2018-04-21
| * gnu: r-genomicalignments: Update to 1.14.2.Ricardo Wurmus2018-04-21
| * gnu: r-dexseq: Update to 1.24.4.Ricardo Wurmus2018-04-21
| * gnu: r-vegan: Update to 2.5-1.Ricardo Wurmus2018-04-21
* | Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver2018-04-10
|\|
| * gnu: sambamba: Update to 0.6.7-10-g223fa20.Ricardo Wurmus2018-04-06
| * gnu: htslib-for-sambamba: Fix build.Ricardo Wurmus2018-04-06
| * gnu: Add delly.Roel Janssen2018-03-30
| * gnu: mash: Update to 2.0.Ben Woodcroft2018-03-30
| * gnu: mafft: Update to 7.394.Ben Woodcroft2018-03-30
| * gnu: diamond: Update to 0.9.19.Ben Woodcroft2018-03-30
* | Merge branch 'master' into core-updatesMarius Bakke2018-03-29
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| * gnu: r-mutationalpatterns: Update to 1.4.3.Roel Janssen2018-03-29
| * gnu: kaiju: Update to 1.6.2.Roel Janssen2018-03-29
| * gnu: r-annotate: Update to 1.56.2.Tobias Geerinckx-Rice2018-03-25
| * gnu: r-bookdown: Do not propagate ghc-pandoc.Ricardo Wurmus2018-03-22
| * gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.10.Ricardo Wurmus2018-03-21
| * gnu: pigx-chipseq: Update to 0.0.9.Ricardo Wurmus2018-03-20
* | gnu: Use invoke and return #t from all builders.Mark H Weaver2018-03-27
* | Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver2018-03-20
|\|
| * gnu: pigx-bsseq: Update to 0.0.8.Ricardo Wurmus2018-03-20
| * gnu: pigx-rnaseq: Update to 0.0.3.Ricardo Wurmus2018-03-20
* | Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver2018-03-20
|\|
| * gnu: pigx-bsseq: Update to 0.0.7.Ricardo Wurmus2018-03-19
| * gnu: bismark: Fix references to gunzip.Ricardo Wurmus2018-03-19
| * gnu: pigx-scrnaseq: Update to 0.0.3.Ricardo Wurmus2018-03-19
| * gnu: pigx: Update to 0.0.2.Ricardo Wurmus2018-03-19
| * gnu: r-rcas: Use ghc-pandoc-citeproc-with-pandoc-1.Ricardo Wurmus2018-03-19