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path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
Commit message (Expand)AuthorAge
* gnu: imp: Disable tests.Ricardo Wurmus2021-12-08
* gnu: snap-aligner: Update to 2.0.0.Ricardo Wurmus2021-12-08
* gnu: snap-aligner: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus2021-12-08
* gnu: snap-aligner: Run tests conditionally.Ricardo Wurmus2021-12-08
* gnu: khmer: Cythonize source files.Ricardo Wurmus2021-12-08
* gnu: cwltool: Update to 3.1.20211107152837.Ricardo Wurmus2021-12-08
* gnu: newick-utils: Pass -fcommon to compiler.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: blasr: Update to 5.3.5.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: blasr: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: blasr-libcpp: Update to 5.3.5.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: htseq: Update to 0.12.3.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: clipper: Update to 2.0.1.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: pbbam: Update to 1.7.0.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: bwa-pssm: Fix build.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: Add pbcopper.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: fsom: Build with GCC 6.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: python-velocyto: Remove generated C files.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: python-schema-salad: Update to 8.2.20211116214159.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: taxtastic: Update to 0.9.2.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: taxtastic: Run tests conditionally.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: python-dendropy: Update to 4.5.1.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: python-cooler: Use python-cytoolz-for-cooler.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: phylip: Update to 3.697.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: phylip: Pass -fcommon to compiler.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: phylip: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: subread: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: subread: Update to 2.0.3.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: subread: Update home page..Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: subread: Pass -fcommon to compiler.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: hisat: Update to 0.1.6.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: hisat: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: hisat: Remove invalid characters.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: crossmap: Update to 0.6.1.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: Remove python2-bx-python.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: python-bx-python: Update to 0.8.12.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: Remove pbtranscript-tofu.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: python-pyfit-sne: Update to 1.2.1.Ricardo Wurmus2021-12-07
* gnu: f-seq: Update name of commons-cli JAR.Ricardo Wurmus2021-12-06
* gnu: f-seq: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus2021-12-06
* gnu: f-seq: Simplify snippet.Ricardo Wurmus2021-12-06
* Merge remote-tracking branch 'origin/master' into core-updates-frozenRicardo Wurmus2021-12-05
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| * gnu: minimap2: Update to 2.23.Efraim Flashner2021-12-05
| * gnu: pigx-sars-cov2-ww: Update to 0.0.4.Ricardo Wurmus2021-12-04
| * gnu: imp: Update to 2.15.0.Ricardo Wurmus2021-12-03
| * gnu: python-ont-fast5-api: Update to 4.0.0.Ricardo Wurmus2021-12-03
| * gnu: Add vbz-compression.Ricardo Wurmus2021-12-03
| * gnu: ivar: Disable parallel tests.Ricardo Wurmus2021-12-03
| * gnu: Remove python2-biom-format.Ricardo Wurmus2021-12-03
| * gnu: ribodiff: Remove trailing #T.Ricardo Wurmus2021-12-02
| * gnu: ribodiff: Disable broken test.Ricardo Wurmus2021-12-02